Ich musste vor kurzem ein DIN A3 PDF in ein DIN A4 PDF zerschneiden. Mit dem Tool briss, welches unter folgendem Link zum Download bereit steht, klappt das einwandfrei.
http://sourceforge.net/projects/briss/
Einfach PDF laden, Rahmen aufziehen und per Vorschau prüfen und ggf. neue Bereiche aufziehen und dann einfach abspeichern!
Super einfach!